“允公允能，日新月异”的校训，表达了南开人的价值取向和精神品质。
早在南开初创之时，校父严修便提出了“尚公”、“尚能”的主张，并在办学过程中一直践行“公能”二义。1934年，校长张伯苓化《诗经•鲁颂》中“允文允武”为“允公允能”作为南开校训。“允”为文言语首助词，“既、又”的意思。“允公允能”意即“既有公德，又有能力”，以培养学生“爱国爱群之公德，与服务社会之能力”。“日新月异”语本《礼记•大学》：“汤之盘铭曰：‘苟日新，日日新，又日新。”意即与时俱进，每天每月都要有所创新和发展。南开校训作为一种永久的精神力量、博大的精神力量、强烈的感召力量，启迪陶冶了一代又一代的南开人，鼓舞他们为民族的振兴和社会的发展贡献力量。
校训中文标准字体源自1962年4月吴玉如为张伯苓校长夫妇合葬墓碑撰写的碑文拓片，后加以标准化处理。
英文校训字体A
英文校训字体B