南开大学的校色为青莲紫，又名南开紫。荷花亦名莲花，因“华实齐生、百节疏通、万窍玲珑、亭亭物华”，而被誉为“花之君子”。宋人周敦颐的《爱莲说》，道出了莲花的君子品格——“出淤泥而不染，濯清涟而不妖，中通外直，不蔓不枝，香远益清，亭亭净植，可远观而不可亵玩焉”。“出淤泥而不染，濯清涟而不妖”，写出了莲花虽处污泥之中却纤尘不染，虽经清水洗涤却不露媚态的可贵精神；“中通外直，不蔓不枝”，写出了莲花里外贯通、表里如一、不牵扯攀附的高尚品质。正因如此，莲花才能“香远益清”，这也是南开人历来追求的人生境界。由于青莲紫体现了南开人温厚儒雅、文质彬彬的谦谦君子品格，蓬勃向上、百折不挠的精神气质，一直为南开人所崇尚和喜爱，故将其作为南开校色，校徽、校旗等一些南开标识物均以之为色彩基调。《南开大学章程》第84条对校色做出了明确规定。